学校成立于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）在重庆创办，前身为重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国*院学位委员会批准的首批博士、硕士学位授予单位之一，也是教育部批准的首批来华留学示范基地之一。2022年，学校成为重庆市人民政府、国家卫生和计划生育委员会（原国家卫生和计划生育委员会）和教育部共同组建的大学。2022年，学校成为首批通过“大学学科创新和人才引进计划”（“111计划”）的地方大学之一。
学校由渝中区袁家岗校区和重庆大学城缙云校区组成，总占地面积2650亩。缙云校区占地2100亩，校园环境优美，风景如画。
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全日制在校生25760人，其中研究生5740人，本科生19310人，留学生710人。学校具备招收博士后研究员、港澳台学生和外国留学生的资格。
学校拥有一级学科博士学位授权点7个，一级学科硕士学位授权点12个，博士专业学位授权点3个，硕士专业学位授权点11个；“十三五”期间，四个国家重点学科、四个进入全球ESI前1%的学科（科瑞维安于2022年3月发布）、四个重庆市一级学科、12个重庆市级重点学科。在教育部学位中心第四轮学科评估中，临床医学等学科位列全国前列。
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学校有21个学院（系）和研究生院。设立34个本科专业。重庆市“三个专项行动计划”有12个特色专业，重庆市“三个专项行动计划”有6个特色学科专业群。临床医学已通过国际临床医学专业认证，口腔护士护理已通过教育部专业认证。现有国家级实验教学示范中心4个，国家级精品资源共享课程4门，国家级精品视频公共课程3门。
目前，学校拥有“973”首席科学家2名，国家“千人计划”专家7名，“长江学者”6名，国家“十万人才工程”候选人9名，国*院“政府特别津贴”获得者，“卫生部有突出贡献的中青年专家”，“国家杰出青年科学基金”、“国家杰出青年科学基金”、“教育部新世纪优秀人才支持计划”重庆有“两江学者”、“首席专家工作室领军专家”、学术技术带头人等100多名高层次人才。教师总数2220人，其中高级专业技术人员1340人。博士生导师239人。有5个流动博士后研究站。
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